Contiene: Las tribulaciones de un ilustrado católico. José Eusebio Llano Zapata en Cádiz (1756-1780) por Víctor Peralta Ruiz; La historia natural en las Memorias de José Eusebio de Llano Zapata por Luis Millones Figueroa; La larga sombra de León Pinelo en las Memorias de Llano Zapata por Antonio Garrido Aranda; Bibliografía general de los estudios preliminares; Memorias histórico, físicas, crítico, apologéticas de la América Meridional; Tomo I. Artículo preliminar, en que se da una breve idea para el mayor acierto de escribir historia natural y se previenen los escollos en que han tropezado los más escritores de las Américas Septentrional y Meridional Reino mineral. Artículo 1°. Minas de plata; Artículo 2°. Minas de oro; Artículo 3°. Del primer oro que se condujo a España de las Indias al principio de su Descubrimiento; Artículo 4°. Promesa y rescate del rey Atahualpa; Artículo 5°. Presa del Cuzco; Artículo 6°. Entierros y huacas; Artículo 7°. Varía imaginación de buscar tesoros enterrados, dejando lo cierto por lo dudoso; Artículo 8°. Minas de hierro, acero, plomo, estaño, cobre y otros metales; Artículo 9°. Minas de azogue; Artículo 10°. De piedras preciosas y otros minerales; Artículo 11°. De perlas y corales; Artículo 12°. De la piedra imán; Artículo 13°. Mármoles preciosos, tierras olorosas y de varios colores; Artículo 14°. De lagos de sal petrificada y minas de sal de piedra; Artículo 15°. De minas de sal amoniaco, alumbre cristalino y de roca, de azufre, antimonio, vitriolo, bórax o tincar y arsénico; Artículo 16°. De lagunas, lagos y vertientes; Artículo 17°. De volcanes, termas y fuentes de petróleo y betunes; Artículo 18°. Minas de exhalaciones mortales (cuevas y grutas); Artículo 19°. De caminos, acueductos y puentes; Artículo 20°. De inscripciones, medallas, edificios, templos, antigüedades y monumentos Adiciones. Tomo II: Artículo 1°. Árboles de maderas preciosas y frutos útiles a varias enfermedades y usos; Artículo 2°. De árboles balsámicos, frutos aromáticos, cortezas olorosas, cascaras antifebrífugas. Gomas, resinas, maderas y semillas para varios tintes y colores.; Artículo 3°. De varias plantas cuyas hojas y raíces sirven a usos medicinales y otros. Tomo III: Artículo 1°. De los cuadrúpedos útiles al hombre a varios usos y a su sustento; Artículo 2°. De otros animales comestibles Como son las liebres, el quirquincho, el mataco y monos cuyas carnes comen los indios; Artículo 3°. De los animales feroces como son leones, tigres, osos y la ardilla; Artículo 4°. De algunos animales dañosos, como son el muca muca, otra especie del mismo, el zorro o zorrino y la zorra; Artículo 5°. La gran bestia que los españoles llaman danta y la que irónicamente llaman perico ligero; Artículo 6°..Del unicornio, grifos, elefantes y martas cebellinas; Artículo 7°. De los reptiles como son las culebras, serpientes, hidras y víboras; Artículo 8°. Insectos y volátiles; Segunda parte: Artículo 1°. De la Ornitología en que se trata de las aves; Artículo 2°. De las aves comestibles como pavas y perdices; Artículo 3°. Pájaros de plumaje peregrino; Artículo 4°. Aves cantoras; Artículo 5° Avecillas de raros efectos; Artículo 6°. Animales acuátiles; Artículo 7°. De los tritones, sirenas y monos marinos; Artículo 8°. De otras nuevas monstruosidades; Correspondencia de Llano Zapata; Bibliografía

Dentro de su análisis se destaca una defensa del mundo natural de la América Meridional y una refutación de la interpretación fantástica de la fauna por parte de algunos extranjeros. Se realiza una descripción de la quincha, el plátano (“socorro de todo pobre”), la palta como preventiva de las resacas, el tabaco, las enfermedades venéreas, y una serie de animales como el avestruz, el cóndor, y el unicornio. Otra característica de esta obra es su intención de trascender la historia natural del Perú. Tiene comparaciones con México y España e incorpora las observaciones y estudios hechos en sus viajes por los Andes, el Río de la Plata, y el Brasil.